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<xsl:output indent="yes" method="text"/>
<xsl:key name="terms" match="term" use="id"/>
<xsl:template mode="id" match="*">
<xsl:value-of select="translate(.,':','_')"/>
</xsl:template>
<xsl:template match="/">
<!-- ******** -->
<!-- ONTOLOGY -->
<!-- ******** -->
<xsl:text>(in-knowledge-base test x-test) </xsl:text>
<xsl:text>(signature :atomic-concepts (</xsl:text>
<xsl:for-each select="obo/term">
<xsl:text> </xsl:text>
<xsl:apply-templates mode="id" select="id"/>
<xsl:text> </xsl:text>
</xsl:for-each>
<xsl:text>) :roles (</xsl:text>
<xsl:for-each select="obo/typedef">
<xsl:text> (</xsl:text>
<xsl:apply-templates mode="id" select="id"/>
<xsl:text>) </xsl:text>
</xsl:for-each>
<xsl:text>)) </xsl:text>
<xsl:apply-templates select="obo/term"/>
<!-- ******* -->
<!-- QUERIES -->
<!-- ******* -->
<!-- check existing predictions -->
<xsl:for-each select="obo/term/is_a[@novel_inferred='true']">
<xsl:text>(concept-subsumes? </xsl:text>
<xsl:apply-templates mode="id" select="."/>
<xsl:text> </xsl:text>
<xsl:apply-templates mode="id" select="../id"/>
<xsl:text>) </xsl:text>
</xsl:for-each>
<!-- check for new subsumptions -->
<xsl:for-each select="obo/term">
<xsl:text>(concept-ancestors </xsl:text>
<xsl:apply-templates mode="id" select="id"/>
<xsl:text>) </xsl:text>
</xsl:for-each>
</xsl:template>
<xsl:template match="term">
<xsl:apply-templates select="is_a"/>
<xsl:apply-templates select="relationship"/>
<xsl:if test="count(intersection_of)>0">
<xsl:text>(equivalent </xsl:text>
<xsl:apply-templates mode="id" select="id"/>
<xsl:text> (and </xsl:text>
<xsl:apply-templates select="intersection_of"/>
<xsl:text>)) </xsl:text>
</xsl:if>
</xsl:template>
<xsl:template match="is_a">
<xsl:if test="not(@novel_inferred) and not(@problematic_inferred)">
<xsl:text>(implies </xsl:text>
<xsl:apply-templates mode="id" select="../id"/>
<xsl:text> </xsl:text>
<xsl:apply-templates mode="id" select="."/>
<xsl:text>) </xsl:text>
</xsl:if>
</xsl:template>
<xsl:template match="relationship">
<xsl:text>(implies </xsl:text>
<xsl:apply-templates mode="id" select="../id"/>
<xsl:text> (some </xsl:text>
<xsl:value-of select="type"/>
<xsl:text> </xsl:text>
<xsl:apply-templates mode="id" select="to"/>
<xsl:text>)) </xsl:text>
</xsl:template>
<xsl:template match="intersection_of">
<xsl:text> </xsl:text>
<xsl:choose>
<xsl:when test="type='is_a'">
<xsl:apply-templates mode="id" select="to"/>
</xsl:when>
<xsl:otherwise>
<xsl:text>(some </xsl:text>
<xsl:value-of select="type"/>
<xsl:text> </xsl:text>
<xsl:apply-templates mode="id" select="to"/>
<xsl:text>)</xsl:text>
</xsl:otherwise>
</xsl:choose>
</xsl:template>
<xsl:template match="text()|@*">
</xsl:template>
</xsl:stylesheet>
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