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; Column 1 : default bondtype
; Column 2 : default angletype
; Column 3 : default proper dihedraltype
; Column 4 : default improper dihedraltype
; Column 5 : This controls the generation of dihedrals from the bonding.
; All possible dihedrals are generated automatically. A value of
; 1 here means that all these are retained. A value of
; 0 here requires generated dihedrals be removed if
; * there are any dihedrals on the same central atoms
; specified in the residue topology, or
; * there are other identical generated dihedrals
; sharing the same central atoms, or
; * there are other generated dihedrals sharing the
; same central bond that have fewer hydrogen atoms
; Column 6 : number of neighbors to exclude from non-bonded interactions
; Column 7 : 1 = generate 1,4 interactions between pairs of hydrogen atoms
; 0 = do not generate such
; Column 8 : 1 = remove proper dihedrals if found centered on the same
; bond as an improper dihedral
; 0 = do not generate such
; bonds angles dihedrals impropers all_dihedrals nrexcl HH14 RemoveDih
1 5 9 2 1 3 1 0
[ LPPC ]
[ atoms ]
N NTL -0.60 0
C13 CTL5 -0.35 1
H13A HL 0.25 2
H13B HL 0.25 3
H13C HL 0.25 4
C14 CTL5 -0.35 5
H14A HL 0.25 6
H14B HL 0.25 7
H14C HL 0.25 8
C15 CTL5 -0.35 9
H15A HL 0.25 10
H15B HL 0.25 11
H15C HL 0.25 12
C12 CTL2 -0.10 13
H12A HL 0.25 14
H12B HL 0.25 15
C11 CTL2 -0.08 16
H11A HAL2 0.09 17
H11B HAL2 0.09 18
P PL 1.50 19
O13 O2L -0.78 20
O14 O2L -0.78 21
O11 OSL -0.57 22
O12 OSL -0.57 23
C1 CTL2 -0.08 24
HA HAL2 0.09 25
HB HAL2 0.09 26
C2 CTL2 -0.18 27
HS HAL2 0.09 28
HR HAL2 0.09 29
C3 CTL2 -0.05 30
HX HAL2 0.09 31
HY HAL2 0.09 32
O31 OSL -0.34 33
C31 CL 0.63 34
O32 OBL -0.52 35
C32 CTL2 -0.08 36
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H2Y HAL2 0.09 38
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H3Y HAL2 0.09 41
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H4Y HAL2 0.09 44
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H5Y HAL2 0.09 47
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H9Y HAL2 0.09 59
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H10Y HAL2 0.09 62
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H11Y HAL2 0.09 65
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H12Y HAL3 0.09 68
H12Z HAL3 0.09 69
[ bonds ]
N C13
N C14
N C15
C13 H13A
C13 H13B
C13 H13C
C14 H14A
C14 H14B
C14 H14C
C15 H15A
C15 H15B
C15 H15C
N C12
C12 H12A
C12 H12B
C12 C11
C11 H11A
C11 H11B
C11 O12
O12 P
P O11
P O13
P O14
C1 HA
C1 HB
C1 C2
C1 O11
C2 HS
C2 HR
C2 C3
C3 HX
C3 HY
C3 O31
O31 C31
C31 C32
C31 O32
C32 H2X
C32 H2Y
C32 C33
C33 H3X
C33 H3Y
C33 C34
C34 H4X
C34 H4Y
C34 C35
C35 H5X
C35 H5Y
C35 C36
C36 H6X
C36 H6Y
C36 C37
C37 H7X
C37 H7Y
C37 C38
C38 H8X
C38 H8Y
C38 C39
C39 H9X
C39 H9Y
C39 C310
C310 H10X
C310 H10Y
C310 C311
C311 H11X
C311 H11Y
C311 C312
C312 H12X
C312 H12Y
C312 H12Z
[ impropers ]
C31 O31 C32 O32
[ GPE ]
[ atoms ]
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H12B HAL2 0.09 6
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H11A HAL2 0.09 8
H11B HAL2 0.09 9
P PL 1.50 10
O13 O2L -0.78 11
O14 O2L -0.78 12
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O12 OSL -0.57 14
C1 CTL2 -0.08 15
HA HAL2 0.09 16
HB HAL2 0.09 17
C2 CTL1 0.14 18
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HO2 HOL 0.43 21
C3 CTL2 0.05 22
HX HAL2 0.09 23
HY HAL2 0.09 24
OH3 OHL -0.66 25
HO3 HOL 0.43 26
[ bonds ]
N HN1
N HN2
N HN3
N C12
C12 H12A
C12 H12B
C12 C11
C11 H11A
C11 H11B
C11 O12
O12 P
P O11
P O13
P O14
C1 HA
C1 HB
C1 C2
C1 O11
C2 HS
C2 C3
C2 OH2
C3 HX
C3 HY
C3 OH3
OH2 HO2
OH3 HO3
[ DLPE ]
[ atoms ]
N NH3L -0.30 0
HN1 HCL 0.33 1
HN2 HCL 0.33 2
HN3 HCL 0.33 3
C12 CTL2 0.13 4
H12A HAL2 0.09 5
H12B HAL2 0.09 6
C11 CTL2 -0.08 7
H11A HAL2 0.09 8
H11B HAL2 0.09 9
P PL 1.50 10
O13 O2L -0.78 11
O14 O2L -0.78 12
O11 OSL -0.57 13
O12 OSL -0.57 14
C1 CTL2 -0.08 15
HA HAL2 0.09 16
HB HAL2 0.09 17
C2 CTL1 0.04 18
HS HAL1 0.09 19
O21 OSL -0.34 20
C21 CL 0.63 21
O22 OBL -0.52 22
C22 CTL2 -0.08 23
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H2S HAL2 0.09 25
C3 CTL2 -0.05 26
HX HAL2 0.09 27
HY HAL2 0.09 28
O31 OSL -0.34 29
C31 CL 0.63 30
O32 OBL -0.52 31
C32 CTL2 -0.08 32
H2X HAL2 0.09 33
H2Y HAL2 0.09 34
C23 CTL2 -0.18 35
H3R HAL2 0.09 36
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C24 CTL2 -0.18 38
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H4S HAL2 0.09 40
C25 CTL2 -0.18 41
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H5S HAL2 0.09 43
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H6R HAL2 0.09 45
H6S HAL2 0.09 46
C27 CTL2 -0.18 47
H7R HAL2 0.09 48
H7S HAL2 0.09 49
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H8S HAL2 0.09 52
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H10S HAL2 0.09 58
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H12T HAL3 0.09 65
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C310 CTL2 -0.18 87
H10X HAL2 0.09 88
H10Y HAL2 0.09 89
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H11Y HAL2 0.09 92
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H12X HAL3 0.09 94
H12Y HAL3 0.09 95
H12Z HAL3 0.09 96
[ bonds ]
N HN1
N HN2
N HN3
N C12
C12 H12A
C12 H12B
C12 C11
C11 H11A
C11 H11B
C11 O12
O12 P
P O11
P O13
P O14
C1 HA
C1 HB
C1 C2
C1 O11
C2 HS
C2 C3
C2 O21
C3 HX
C3 HY
C3 O31
O21 C21
C21 C22
C21 O22
C22 H2R
C22 H2S
C22 C23
C23 H3R
C23 H3S
C23 C24
C24 H4R
C24 H4S
C24 C25
C25 H5R
C25 H5S
C25 C26
C26 H6R
C26 H6S
C26 C27
C27 H7R
C27 H7S
C27 C28
C28 H8R
C28 H8S
C28 C29
C29 H9R
C29 H9S
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C210 H10R
C210 H10S
C210 C211
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C211 H11S
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O31 C31
C31 C32
C31 O32
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C32 H2Y
C32 C33
C33 H3X
C33 H3Y
C33 C34
C34 H4X
C34 H4Y
C34 C35
C35 H5X
C35 H5Y
C35 C36
C36 H6X
C36 H6Y
C36 C37
C37 H7X
C37 H7Y
C37 C38
C38 H8X
C38 H8Y
C38 C39
C39 H9X
C39 H9Y
C39 C310
C310 H10X
C310 H10Y
C310 C311
C311 H11X
C311 H11Y
C311 C312
C312 H12X
C312 H12Y
C312 H12Z
[ impropers ]
C21 O21 C22 O22
C31 O31 C32 O32
[ DMPC ]
[ atoms ]
N NTL -0.60 0
C13 CTL5 -0.35 1
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H13B HL 0.25 3
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H14A HL 0.25 6
H14B HL 0.25 7
H14C HL 0.25 8
C15 CTL5 -0.35 9
H15A HL 0.25 10
H15B HL 0.25 11
H15C HL 0.25 12
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C11 CTL2 -0.08 16
H11A HAL2 0.09 17
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P PL 1.50 19
O13 O2L -0.78 20
O14 O2L -0.78 21
O11 OSL -0.57 22
O12 OSL -0.57 23
C1 CTL2 -0.08 24
HA HAL2 0.09 25
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C2 CTL1 0.04 27
HS HAL1 0.09 28
O21 OSL -0.34 29
C21 CL 0.63 30
O22 OBL -0.52 31
C22 CTL2 -0.08 32
H2R HAL2 0.09 33
H2S HAL2 0.09 34
C3 CTL2 -0.05 35
HX HAL2 0.09 36
HY HAL2 0.09 37
O31 OSL -0.34 38
C31 CL 0.63 39
O32 OBL -0.52 40
C32 CTL2 -0.08 41
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H2Y HAL2 0.09 43
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H4S HAL2 0.09 49
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H5S HAL2 0.09 52
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H10S HAL2 0.09 67
C211 CTL2 -0.18 68
H11R HAL2 0.09 69
H11S HAL2 0.09 70
C212 CTL2 -0.18 71
H12R HAL2 0.09 72
H12S HAL2 0.09 73
C213 CTL2 -0.18 74
H13R HAL2 0.09 75
H13S HAL2 0.09 76
C214 CTL3 -0.27 77
H14R HAL3 0.09 78
H14S HAL3 0.09 79
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C37 CTL2 -0.18 93
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H8X HAL2 0.09 97
H8Y HAL2 0.09 98
C39 CTL2 -0.18 99
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H10X HAL2 0.09 103
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C312 CTL2 -0.18 108
H12X HAL2 0.09 109
H12Y HAL2 0.09 110
C313 CTL2 -0.18 111
H13X HAL2 0.09 112
H13Y HAL2 0.09 113
C314 CTL3 -0.27 114
H14X HAL3 0.09 115
H14Y HAL3 0.09 116
H14Z HAL3 0.09 117
[ bonds ]
N C13
N C14
N C15
C13 H13A
C13 H13B
C13 H13C
C14 H14A
C14 H14B
C14 H14C
C15 H15A
C15 H15B
C15 H15C
N C12
C12 H12A
C12 H12B
C12 C11
C11 H11A
C11 H11B
C11 O12
O12 P
P O11
P O13
P O14
C1 HA
C1 HB
C1 C2
C1 O11
C2 HS
C2 C3
C2 O21
C3 HX
C3 HY
C3 O31
O21 C21
C21 C22
C21 O22
C22 H2R
C22 H2S
C22 C23
C23 H3R
C23 H3S
C23 C24
C24 H4R
C24 H4S
C24 C25
C25 H5R
C25 H5S
C25 C26
C26 H6R
C26 H6S
C26 C27
C27 H7R
C27 H7S
C27 C28
C28 H8R
C28 H8S
C28 C29
C29 H9R
C29 H9S
C29 C210
C210 H10R
C210 H10S
C210 C211
C211 H11R
C211 H11S
C211 C212
C212 H12R
C212 H12S
C212 C213
C213 H13R
C213 H13S
C213 C214
C214 H14R
C214 H14S
C214 H14T
O31 C31
C31 C32
C31 O32
C32 H2X
C32 H2Y
C32 C33
C33 H3X
C33 H3Y
C33 C34
C34 H4X
C34 H4Y
C34 C35
C35 H5X
C35 H5Y
C35 C36
C36 H6X
C36 H6Y
C36 C37
C37 H7X
C37 H7Y
C37 C38
C38 H8X
C38 H8Y
C38 C39
C39 H9X
C39 H9Y
C39 C310
C310 H10X
C310 H10Y
C310 C311
C311 H11X
C311 H11Y
C311 C312
C312 H12X
C312 H12Y
C312 C313
C313 H13X
C313 H13Y
C313 C314
C314 H14X
C314 H14Y
C314 H14Z
[ impropers ]
C21 O21 C22 O22
C31 O31 C32 O32
[ SDS ]
[ atoms ]
S SL 1.33 0
OS1 OSL -0.28 1
OS2 O2L -0.65 2
OS3 O2L -0.65 3
OS4 O2L -0.65 4
C1 CTL2 -0.28 5
H11 HAL2 0.09 6
H12 HAL2 0.09 7
C2 CTL2 -0.18 8
H21 HAL2 0.09 9
H22 HAL2 0.09 10
C3 CTL2 -0.18 11
H31 HAL2 0.09 12
H32 HAL2 0.09 13
C4 CTL2 -0.18 14
H41 HAL2 0.09 15
H42 HAL2 0.09 16
C5 CTL2 -0.18 17
H51 HAL2 0.09 18
H52 HAL2 0.09 19
C6 CTL2 -0.18 20
H61 HAL2 0.09 21
H62 HAL2 0.09 22
C7 CTL2 -0.18 23
H71 HAL2 0.09 24
H72 HAL2 0.09 25
C8 CTL2 -0.18 26
H81 HAL2 0.09 27
H82 HAL2 0.09 28
C9 CTL2 -0.18 29
H91 HAL2 0.09 30
H92 HAL2 0.09 31
C10 CTL2 -0.18 32
H101 HAL2 0.09 33
H102 HAL2 0.09 34
C11 CTL2 -0.18 35
H111 HAL2 0.09 36
H112 HAL2 0.09 37
C12 CTL3 -0.27 38
H121 HAL3 0.09 39
H122 HAL3 0.09 40
H123 HAL3 0.09 41
[ bonds ]
S OS1
S OS2
S OS3
S OS4
OS1 C1
C1 H11
C1 H12
C1 C2
C2 H21
C2 H22
C2 C3
C3 H31
C3 H32
C3 C4
C4 H41
C4 H42
C4 C5
C5 H51
C5 H52
C5 C6
C6 H61
C6 H62
C6 C7
C7 H71
C7 H72
C7 C8
C8 H81
C8 H82
C8 C9
C9 H91
C9 H92
C9 C10
C10 H101
C10 H102
C10 C11
C11 H111
C11 H112
C11 C12
C12 H121
C12 H122
C12 H123
[ POPC ]
[ atoms ]
N NTL -0.60 0
C11 CTL2 -0.10 1
C12 CTL5 -0.35 2
C13 CTL5 -0.35 3
C14 CTL5 -0.35 4
H11 HL 0.25 5
H12 HL 0.25 6
H21 HL 0.25 7
H22 HL 0.25 8
H23 HL 0.25 9
H31 HL 0.25 10
H32 HL 0.25 11
H33 HL 0.25 12
H41 HL 0.25 13
H42 HL 0.25 14
H43 HL 0.25 15
C15 CTL2 -0.08 16
H51 HAL2 0.09 17
H52 HAL2 0.09 18
P1 PL 1.50 19
O3 O2L -0.78 20
O4 O2L -0.78 21
O1 OSL -0.57 22
O2 OSL -0.57 23
C1 CTL2 -0.08 24
HA HAL2 0.09 25
HB HAL2 0.09 26
C2 CTL1 0.04 27
HS HAL1 0.09 28
O21 OSL -0.34 29
C21 CL 0.63 30
O22 OBL -0.52 31
C22 CTL2 -0.08 32
H2R HAL2 0.09 33
H2S HAL2 0.09 34
C3 CTL2 -0.05 35
HX HAL2 0.09 36
HY HAL2 0.09 37
O31 OSL -0.34 38
C31 CL 0.63 39
O32 OBL -0.52 40
C32 CTL2 -0.08 41
H2X HAL2 0.09 42
H2Y HAL2 0.09 43
C23 CTL2 -0.18 44
H3R HAL2 0.09 45
H3S HAL2 0.09 46
C24 CTL2 -0.18 47
H4R HAL2 0.09 48
H4S HAL2 0.09 49
C25 CTL2 -0.18 50
H5R HAL2 0.09 51
H5S HAL2 0.09 52
C26 CTL2 -0.18 53
H6R HAL2 0.09 54
H6S HAL2 0.09 55
C27 CTL2 -0.18 56
H7R HAL2 0.09 57
H7S HAL2 0.09 58
C28 CTL2 -0.18 59
H8R HAL2 0.09 60
H8S HAL2 0.09 61
C29 CEL1 -0.15 62
H91 HEL1 0.15 63
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H101 HEL1 0.15 65
C211 CTL2 -0.18 66
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C215 CTL2 -0.18 78
H15R HAL2 0.09 79
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C218 CTL3 -0.27 87
H18R HAL3 0.09 88
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H18T HAL3 0.09 90
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H5X HAL2 0.09 98
H5Y HAL2 0.09 99
C36 CTL2 -0.18 100
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H12X HAL2 0.09 119
H12Y HAL2 0.09 120
C313 CTL2 -0.18 121
H13X HAL2 0.09 122
H13Y HAL2 0.09 123
C314 CTL2 -0.18 124
H14X HAL2 0.09 125
H14Y HAL2 0.09 126
C315 CTL2 -0.18 127
H15X HAL2 0.09 128
H15Y HAL2 0.09 129
C316 CTL3 -0.27 130
H16X HAL3 0.09 131
H16Y HAL3 0.09 132
H16Z HAL3 0.09 133
[ bonds ]
N C11
N C12
N C13
N C14
C11 H11
C11 H12
C11 C15
C12 H21
C12 H22
C12 H23
C13 H31
C13 H32
C13 H33
C14 H41
C14 H42
C14 H43
C15 H51
C15 H52
P1 O1
P1 O2
P1 O3
P1 O4
O1 C15
O2 C1
C1 HA
C1 HB
C1 C2
C2 HS
C2 C3
C2 O21
C3 HX
C3 HY
C3 O31
O21 C21
C21 C22
C21 O22
C22 H2R
C22 H2S
C22 C23
C23 H3R
C23 H3S
C23 C24
C24 H4R
C24 H4S
C24 C25
C25 H5R
C25 H5S
C25 C26
C26 H6R
C26 H6S
C26 C27
C27 H7R
C27 H7S
C27 C28
C28 H8R
C28 H8S
C28 C29
C29 H91
C29 C210
C210 H101
C210 C211
C211 H11R
C211 H11S
C211 C212
C212 H12R
C212 H12S
C212 C213
C213 H13R
C213 H13S
C213 C214
C214 H14R
C214 H14S
C214 C215
C215 H15R
C215 H15S
C215 C216
C216 H16R
C216 H16S
C216 C217
C217 H17R
C217 H17S
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C218 H18R
C218 H18S
C218 H18T
O31 C31
C31 C32
C31 O32
C32 H2X
C32 H2Y
C32 C33
C33 H3X
C33 H3Y
C33 C34
C34 H4X
C34 H4Y
C34 C35
C35 H5X
C35 H5Y
C35 C36
C36 H6X
C36 H6Y
C36 C37
C37 H7X
C37 H7Y
C37 C38
C38 H8X
C38 H8Y
C38 C39
C39 H9X
C39 H9Y
C39 C310
C310 H10X
C310 H10Y
C310 C311
C311 H11X
C311 H11Y
C311 C312
C312 H12X
C312 H12Y
C312 C313
C313 H13X
C313 H13Y
C313 C314
C314 H14X
C314 H14Y
C314 C315
C315 H15X
C315 H15Y
C315 C316
C316 H16X
C316 H16Y
C316 H16Z
[ impropers ]
C21 O21 C22 O22
C31 O31 C32 O32
[ POPE ]
[ atoms ]
N NH3L -0.30 0
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HN3 HCL 0.33 3
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H12A HAL2 0.09 5
H12B HAL2 0.09 6
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H11A HAL2 0.09 8
H11B HAL2 0.09 9
P PL 1.50 10
O13 O2L -0.78 11
O14 O2L -0.78 12
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O12 OSL -0.57 14
C1 CTL2 -0.08 15
HA HAL2 0.09 16
HB HAL2 0.09 17
C2 CTL1 0.04 18
HS HAL1 0.09 19
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C21 CL 0.63 21
O22 OBL -0.52 22
C22 CTL2 -0.08 23
H2R HAL2 0.09 24
H2S HAL2 0.09 25
C3 CTL2 -0.05 26
HX HAL2 0.09 27
HY HAL2 0.09 28
O31 OSL -0.34 29
C31 CL 0.63 30
O32 OBL -0.52 31
C32 CTL2 -0.08 32
H2X HAL2 0.09 33
H2Y HAL2 0.09 34
C23 CTL2 -0.18 35
H3R HAL2 0.09 36
H3S HAL2 0.09 37
C24 CTL2 -0.18 38
H4R HAL2 0.09 39
H4S HAL2 0.09 40
C25 CTL2 -0.18 41
H5R HAL2 0.09 42
H5S HAL2 0.09 43
C26 CTL2 -0.18 44
H6R HAL2 0.09 45
H6S HAL2 0.09 46
C27 CTL2 -0.18 47
H7R HAL2 0.09 48
H7S HAL2 0.09 49
C28 CTL2 -0.18 50
H8R HAL2 0.09 51
H8S HAL2 0.09 52
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H14S HAL2 0.09 68
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H15R HAL2 0.09 70
H15S HAL2 0.09 71
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H16R HAL2 0.09 73
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C217 CTL2 -0.18 75
H17R HAL2 0.09 76
H17S HAL2 0.09 77
C218 CTL3 -0.27 78
H18R HAL3 0.09 79
H18S HAL3 0.09 80
H18T HAL3 0.09 81
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H3Y HAL2 0.09 84
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H5X HAL2 0.09 89
H5Y HAL2 0.09 90
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C37 CTL2 -0.18 94
H7X HAL2 0.09 95
H7Y HAL2 0.09 96
C38 CTL2 -0.18 97
H8X HAL2 0.09 98
H8Y HAL2 0.09 99
C39 CTL2 -0.18 100
H9X HAL2 0.09 101
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H10Y HAL2 0.09 105
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H11X HAL2 0.09 107
H11Y HAL2 0.09 108
C312 CTL2 -0.18 109
H12X HAL2 0.09 110
H12Y HAL2 0.09 111
C313 CTL2 -0.18 112
H13X HAL2 0.09 113
H13Y HAL2 0.09 114
C314 CTL2 -0.18 115
H14X HAL2 0.09 116
H14Y HAL2 0.09 117
C315 CTL2 -0.18 118
H15X HAL2 0.09 119
H15Y HAL2 0.09 120
C316 CTL3 -0.27 121
H16X HAL3 0.09 122
H16Y HAL3 0.09 123
H16Z HAL3 0.09 124
[ bonds ]
N HN1
N HN2
N HN3
N C12
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C12 H12B
C12 C11
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C11 H11B
C11 O12
O12 P
P O11
P O13
P O14
C1 HA
C1 HB
C1 C2
C1 O11
C2 HS
C2 C3
C2 O21
C3 HX
C3 HY
C3 O31
O21 C21
C21 C22
C21 O22
C22 H2R
C22 H2S
C22 C23
C23 H3R
C23 H3S
C23 C24
C24 H4R
C24 H4S
C24 C25
C25 H5R
C25 H5S
C25 C26
C26 H6R
C26 H6S
C26 C27
C27 H7R
C27 H7S
C27 C28
C28 H8R
C28 H8S
C28 C29
C29 H91
C29 C210
C210 H101
C210 C211
C211 H11R
C211 H11S
C211 C212
C212 H12R
C212 H12S
C212 C213
C213 H13R
C213 H13S
C213 C214
C214 H14R
C214 H14S
C214 C215
C215 H15R
C215 H15S
C215 C216
C216 H16R
C216 H16S
C216 C217
C217 H17R
C217 H17S
C217 C218
C218 H18R
C218 H18S
C218 H18T
O31 C31
C31 C32
C31 O32
C32 H2X
C32 H2Y
C32 C33
C33 H3X
C33 H3Y
C33 C34
C34 H4X
C34 H4Y
C34 C35
C35 H5X
C35 H5Y
C35 C36
C36 H6X
C36 H6Y
C36 C37
C37 H7X
C37 H7Y
C37 C38
C38 H8X
C38 H8Y
C38 C39
C39 H9X
C39 H9Y
C39 C310
C310 H10X
C310 H10Y
C310 C311
C311 H11X
C311 H11Y
C311 C312
C312 H12X
C312 H12Y
C312 C313
C313 H13X
C313 H13Y
C313 C314
C314 H14X
C314 H14Y
C314 C315
C315 H15X
C315 H15Y
C315 C316
C316 H16X
C316 H16Y
C316 H16Z
[ impropers ]
C21 O21 C22 O22
C31 O31 C32 O32
[ PALM ]
[ atoms ]
C1 CL 0.62 0
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O2 OCL -0.76 2
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H8A HAL2 0.09 22
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C9 CTL2 -0.18 24
H9A HAL2 0.09 25
H9B HAL2 0.09 26
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H10A HAL2 0.09 28
H10B HAL2 0.09 29
C11 CTL2 -0.18 30
H11A HAL2 0.09 31
H11B HAL2 0.09 32
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H12A HAL2 0.09 34
H12B HAL2 0.09 35
C13 CTL2 -0.18 36
H13A HAL2 0.09 37
H13B HAL2 0.09 38
C14 CTL2 -0.18 39
H14A HAL2 0.09 40
H14B HAL2 0.09 41
C15 CTL2 -0.18 42
H15A HAL2 0.09 43
H15B HAL2 0.09 44
C16 CTL3 -0.27 45
H16A HAL3 0.09 46
H16B HAL3 0.09 47
H16C HAL3 0.09 48
[ bonds ]
C1 O1
C1 O2
C1 C2
C2 H2A
C2 H2B
C2 C3
C3 H3A
C3 H3B
C3 C4
C4 H4A
C4 H4B
C4 C5
C5 H5A
C5 H5B
C5 C6
C6 H6A
C6 H6B
C6 C7
C7 H7A
C7 H7B
C7 C8
C8 H8A
C8 H8B
C8 C9
C9 H9A
C9 H9B
C9 C10
C10 H10A
C10 H10B
C10 C11
C11 H11A
C11 H11B
C11 C12
C12 H12A
C12 H12B
C12 C13
C13 H13A
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C13 C14
C14 H14A
C14 H14B
C14 C15
C15 H15A
C15 H15B
C15 C16
C16 H16A
C16 H16B
C16 H16C
[ impropers ]
C1 O1 C2 O2
[ OLEO ]
[ atoms ]
C1 CL 0.62 0
O1 OCL -0.76 1
O2 OCL -0.76 2
C2 CTL2 -0.28 3
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H7B HAL2 0.09 20
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H12B HAL2 0.09 33
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H13A HAL2 0.09 35
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C14 CTL2 -0.18 37
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H14B HAL2 0.09 39
C15 CTL2 -0.18 40
H15A HAL2 0.09 41
H15B HAL2 0.09 42
C16 CTL2 -0.18 43
H16A HAL2 0.09 44
H16B HAL2 0.09 45
C17 CTL2 -0.18 46
H17A HAL2 0.09 47
H17B HAL2 0.09 48
C18 CTL3 -0.27 49
H18A HAL3 0.09 50
H18B HAL3 0.09 51
H18C HAL3 0.09 52
[ bonds ]
C1 O1
C1 C2
C2 C3
C2 H2A
C2 H2B
C3 C4
C3 H3A
C3 H3B
C4 C5
C4 H4A
C4 H4B
C5 C6
C5 H5A
C5 H5B
C6 C7
C6 H6A
C6 H6B
C7 C8
C7 H7A
C7 H7B
C8 C9
C8 H8A
C8 H8B
C9 C10
C9 H9A
C10 C11
C10 H10A
C11 C12
C11 H11A
C11 H11B
C12 C13
C12 H12A
C12 H12B
C13 C14
C13 H13A
C13 H13B
C14 C15
C14 H14A
C14 H14B
C15 C16
C15 H15A
C15 H15B
C16 C17
C16 H16A
C16 H16B
C17 C18
C17 H17A
C17 H17B
C18 H18C
C18 H18A
C18 H18B
[ DHA ]
[ atoms ]
C1 CL 0.62 0
O1 OCL -0.76 1
O2 OCL -0.76 2
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H2A HAL2 0.09 4
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H3B HAL2 0.09 8
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H4 HEL1 0.15 10
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H5 HEL1 0.15 12
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H6A HAL2 0.09 14
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H8 HEL1 0.15 19
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H9A HAL2 0.09 21
H9B HAL2 0.09 22
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H11 HEL1 0.15 26
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H12B HAL2 0.09 29
C13 CEL1 -0.15 30
H13 HEL1 0.15 31
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H14 HEL1 0.15 33
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H15A HAL2 0.09 35
H15B HAL2 0.09 36
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H17 HEL1 0.15 40
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H18B HAL2 0.09 43
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H19 HEL1 0.15 45
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H20 HEL1 0.15 47
C21 CTL2 -0.18 48
H21A HAL2 0.09 49
H21B HAL2 0.09 50
C22 CTL3 -0.27 51
H22A HAL3 0.09 52
H22B HAL3 0.09 53
H22C HAL3 0.09 54
[ bonds ]
C1 O1
C1 C2
C2 C3
C2 H2A
C2 H2B
C3 C4
C3 H3A
C3 H3B
C4 C5
C4 H4
C5 C6
C5 H5
C6 C7
C6 H6A
C6 H6B
C7 C8
C7 H7
C8 C9
C8 H8
C9 C10
C9 H9A
C9 H9B
C10 C11
C10 H10
C11 C12
C11 H11
C12 C13
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C12 H12B
C13 C14
C13 H13
C14 C15
C14 H14
C15 C16
C15 H15A
C15 H15B
C16 C17
C16 H16
C17 C18
C17 H17
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C18 H18A
C18 H18B
C19 C20
C19 H19
C20 C21
C20 H20
C21 C22
C21 H21A
C21 H21B
C22 H22C
C22 H22A
C22 H22B
[ STEA ]
[ atoms ]
C1 CL 0.62 0
O1 OCL -0.76 1
O2 OCL -0.76 2
C2 CTL2 -0.28 3
H2A HAL2 0.09 4
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H3B HAL2 0.09 8
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H17B HAL2 0.09 50
C18 CTL3 -0.27 51
H18A HAL3 0.09 52
H18B HAL3 0.09 53
H18C HAL3 0.09 54
[ bonds ]
C1 O1
C1 C2
C2 C3
C2 H2A
C2 H2B
C3 C4
C3 H3A
C3 H3B
C4 C5
C4 H4A
C4 H4B
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C5 H5A
C5 H5B
C6 C7
C6 H6A
C6 H6B
C7 C8
C7 H7A
C7 H7B
C8 C9
C8 H8A
C8 H8B
C9 C10
C9 H9A
C9 H9B
C10 C11
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C13 C14
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C15 C16
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C18 H18A
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[ PCGL ]
[ atoms ]
N NTL -0.60 0
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H8C HL 0.25 15
C4 CTL2 -0.08 16
H4A HAL2 0.09 17
H4B HAL2 0.09 18
P PL 1.50 19
OP3 O2L -0.78 20
OP4 O2L -0.78 21
OP1 OSL -0.57 22
OP2 OSL -0.57 23
C3 CTL2 -0.08 24
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H3B HAL2 0.09 26
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O2 OHL -0.66 29
H2 HOL 0.43 30
C1 CTL2 0.05 31
H1A HAL2 0.09 32
H1B HAL2 0.09 33
O1 OHL -0.66 34
H1 HOL 0.43 35
[ bonds ]
N C5
N C6
N C7
N C8
C5 C4
C4 OP2
OP2 P
P OP1
P OP3
P OP4
OP1 C3
C3 C2
C2 C1
C2 O2
C1 O1
O1 H1
O2 H2
C1 H1A
C1 H1B
C2 H2A
C3 H3A
C3 H3B
C4 H4A
C4 H4B
C5 H5A
C5 H5B
C6 H6A
C6 H6B
C6 H6C
C7 H7A
C7 H7B
C7 H7C
C8 H8A
C8 H8B
C8 H8C
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