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; i j func b0 kb
C O 1 0.12300 502080.
C OM 1 0.12500 418400.
C OA 1 0.13600 376560.
C N 1 0.13300 418400.
C NT 1 0.13300 376560.
C NL 1 0.13300 376560.
CH1 OA 1 0.14300 334720.
CH1 N 1 0.14700 376560.
CH1 NT 1 0.14700 376560.
CH1 NL 1 0.14700 376560.
CH1 C 1 0.15300 334720.
CH1 CH1 1 0.15300 334720.
CH2 OM 1 0.14300 376560.
CH2 OA 1 0.14300 334720.
CH2 N 1 0.14700 376560.
CH2 NT 1 0.14700 376560.
CH2 NL 1 0.14700 376560.
CH2 C 1 0.15300 334720.
CH2 CH1 1 0.15300 334720.
CH2 CH2 1 0.15300 334720.
CH3 N 1 0.14700 376560.
CH3 C 1 0.15300 334720.
CH3 CH1 1 0.15300 334720.
CH3 CH2 1 0.15300 334720.
CR51 NR5 1 0.13300 418400.
CR51 NR5* 1 0.13300 418400.
CR61 CH2 1 0.13900 418400.
CR61 CR61 1 0.13900 418400.
CB O 1 0.12300 502080.
CB OA 1 0.13600 376560.
CB NT 1 0.13300 376560.
CB NR5 1 0.13300 418400.
CB NR5* 1 0.13300 418400.
CB NP 1 0.13800 418400.
CB C 1 0.15300 334720.
CB CH2 1 0.15300 334720.
CB CH3 1 0.15300 334720.
CB CR51 1 0.13300 418400.
CB CR61 1 0.13900 418400.
CB CB 1 0.13900 418400.
CHE O 1 0.12300 502080.
CHE OA 1 0.13600 376560.
CHE NT 1 0.13300 376560.
CHE NR5 1 0.13300 418400.
CHE NR5* 1 0.13300 418400.
CHE NP 1 0.13800 418400.
CHE C 1 0.15300 334720.
CHE CH2 1 0.15300 334720.
CHE CH3 1 0.15300 334720.
CHE CR51 1 0.13300 418400.
CHE CR61 1 0.13900 418400.
CHE CB 1 0.13900 418400.
CHE CHE 1 0.13900 418400.
H N 1 0.10000 374468.
H NT 1 0.10000 374468.
H NL 1 0.10000 374468.
H NR5* 1 0.10000 374468.
HO OA 1 0.10000 313800.
HW OW 1 0.10000 418400.
S O 1 0.15000 376560.
S CH2 1 0.18300 376560.
S CH3 1 0.17800 376560.
S HS 1 0.13300 313800.
S S 1 0.20400 418400.
FE NR5 1 0.19800 418400.
FE NP 1 0.20900 418400.
NZ C 1 0.13400 376560.
NZ H 1 0.10000 374468.
NE C 1 0.13400 376560.
NE CH2 1 0.14700 376560.
NE H 1 0.10000 374468.
P OM 1 0.14800 376560.
P OA 1 0.16100 251040.
OS CH2 1 0.14300 251040.
OS P 1 0.16100 251040.
CS1 OA 1 0.14300 251040.
CS1 NR5* 1 0.14800 251040.
CS1 CH2 1 0.15300 251040.
CS1 OS 1 0.14350 251040.
CS1 CS1 1 0.15200 251040.
NR6 CR61 1 0.13200 418400.
NR6 CB 1 0.13400 418400.
NR6 CHE 1 0.13400 418400.
NR6* CH2 1 0.14800 334720.
NR6* CH3 1 0.14800 334720.
NR6* CR61 1 0.14000 334720.
NR6* CB 1 0.14000 334720.
NR6* CHE 1 0.14000 334720.
NR6* H 1 0.10000 374468.
NR6* CS1 1 0.14800 334720.
CS2 OA 1 0.14300 251040.
CS2 CR61 1 0.13900 334720.
CS2 CB 1 0.13900 334720.
CS2 CHE 1 0.13900 334720.
CS2 OS 1 0.14350 251040.
CS2 CS1 1 0.15200 251040.
CS2 NR6* 1 0.14000 334720.
SI CH1 1 0.18700 251040.
SI OS 1 0.16300 251040.
F C 1 0.13600 418400.
CR5 HCR 1 0.10800 292880.
CR6 HCR 1 0.10800 292880.
CB CR6 1 0.13900 418400.
CHE CR6 1 0.13900 418400.
CR51 CR51 1 0.13300 418400.
NR6 CH2 1 0.13400 418400.
; NR6* CH2 1 0.13400 418400.
NR6* CR5 1 0.13400 418400.
CB CR5 1 0.13900 418400.
CHE CR5 1 0.13900 418400.
CR5 NR5 1 0.13300 418400.
CR5 NR5* 1 0.13300 418400.
CR6 CH2 1 0.13900 418400.
CR6 CR6 1 0.13900 418400.
CP2 CP2 1 0.15300 334720.
CP3 CP2 1 0.15300 334720.
C CP2 1 0.15300 334720.
OS C 1 0.14350 251040.
CH1 OS 1 0.14350 251040.
OM S 1 0.15000 376650.
; get the constraint distances:
#include "ff_dum.itp"
[ constrainttypes ]
; now the constraints for the rigid NH3 groups
MNH3 C 2 DC_MNC1
MNH3 CB 2 DC_MNC1
MNH3 CHE 2 DC_MNC1
MNH3 CH1 2 DC_MNC2
MNH3 CH2 2 DC_MNC2
MNH3 MNH3 2 DC_MNMN
; and the angle-constraints for OH and SH groups in proteins:
CH2 HS 2 DC_CS
CH2 HO 2 DC_CO
CH1 HO 2 DC_CO
CB HO 2 DC_CO
C HO 2 DC_CO
P HO 2 DC_PO
[ angletypes ]
; i j k func th0 cth
HO OA C 1 109.500 397.480
HO OA CH1 1 109.500 397.480
HO OA CH2 1 109.500 397.480
HO OA CB 1 109.500 397.480
HO OA CHE 1 109.500 397.480
P OA HO 1 109.500 397.480
CS1 OA HO 1 109.500 397.480
CS2 OA HO 1 109.500 397.480
HW OW HW 1 109.500 502.080
CH1 N C 1 122.000 502.080
CH2 N C 1 122.000 502.080
CH2 N CH1 1 116.000 502.080
CH3 N C 1 117.000 502.080
CH3 N CH1 1 125.000 502.080
CH3 N CH2 1 125.000 502.080
H N C 1 123.000 292.880
H N CH1 1 115.000 376.560
H N CH2 1 115.000 376.560
H N CH3 1 120.000 376.560
H NT C 1 120.000 292.880
H NT CH1 1 120.000 376.560
H NT CH2 1 120.000 376.560
H NT CB 1 120.000 292.880
H NT CHE 1 120.000 292.880
H NT H 1 120.000 334.720
H NL C 1 109.500 376.560
H NL CH1 1 109.500 376.560
H NL CH2 1 109.500 376.560
H NL H 1 109.500 334.720
CR51 NR5 CR51 1 108.000 418.400
CB NR5 CR51 1 108.000 418.400
CHE NR5 CR51 1 108.000 418.400
FE NR5 CR51 1 125.000 251.040
CR51 NR5* CR51 1 108.000 418.400
CB NR5* CR51 1 108.000 418.400
CHE NR5* CR51 1 108.000 418.400
CS1 NR5* CR51 1 126.000 418.400
CS1 NR5* CB 1 126.000 418.400
CS1 NR5* CHE 1 126.000 418.400
H NR5* CR51 1 126.000 376.560
H NR5* CB 1 126.000 376.560
CB NP CB 1 108.000 418.400
FE NP CB 1 126.000 418.400
H NR5* CHE 1 126.000 376.560
CB NP CHE 1 108.000 418.400
FE NP CHE 1 126.000 418.400
CHE NP CHE 1 108.000 418.400
OM C OM 1 126.000 502.080
OA C O 1 124.000 502.080
N C O 1 124.000 502.080
NT C O 1 124.000 502.080
NL C O 1 124.000 502.080
CH1 C O 1 121.000 502.080
CH1 C OM 1 117.000 502.080
CH1 C OA 1 115.000 502.080
CH1 C N 1 115.000 502.080
CH1 C NT 1 115.000 502.080
CH2 C O 1 121.000 502.080
CH2 C OM 1 117.000 502.080
CH2 C OA 1 115.000 502.080
CH2 C N 1 115.000 502.080
CH2 C NT 1 115.000 502.080
CH2 C NL 1 115.000 502.080
CH3 C O 1 121.000 502.080
CH3 C N 1 115.000 502.080
CB C O 1 121.000 502.080
CB C N 1 115.000 502.080
CB C NT 1 115.000 502.080
CHE C O 1 121.000 502.080
CHE C N 1 115.000 502.080
CHE C NT 1 115.000 502.080
NZ C NZ 1 120.000 502.080
NE C NZ 1 120.000 502.080
C CH1 N 1 109.500 460.240
C CH1 NT 1 109.500 460.240
C CH1 NL 1 109.500 460.240
CH1 CH1 OA 1 109.500 460.240
CH1 CH1 N 1 109.500 460.240
CH1 CH1 NT 1 109.500 460.240
CH1 CH1 NL 1 109.500 460.240
CH1 CH1 C 1 109.500 460.240
CH1 CH1 CH1 1 111.000 460.240
CH2 CH1 OA 1 109.500 460.240
CH2 CH1 N 1 109.500 460.240
CH2 CH1 NT 1 109.500 460.240
CH2 CH1 NL 1 109.500 460.240
CH2 CH1 C 1 109.500 460.240
CH2 CH1 CH1 1 111.000 460.240
CH2 CH1 CH2 1 109.500 460.240
CH3 CH1 OA 1 111.000 460.240
CH3 CH1 N 1 109.500 460.240
CH3 CH1 NT 1 109.500 460.240
CH3 CH1 NL 1 109.500 460.240
CH3 CH1 C 1 109.500 460.240
CH3 CH1 CH1 1 111.000 460.240
CH3 CH1 CH2 1 111.000 460.240
CH3 CH1 CH3 1 111.000 460.240
SI CH1 CH3 1 109.500 460.240
C CH2 N 1 109.500 460.240
C CH2 NT 1 109.500 460.240
C CH2 NL 1 109.500 460.240
CH1 CH2 OA 1 109.500 460.240
CH1 CH2 N 1 109.500 460.240
CH1 CH2 C 1 111.000 460.240
CH1 CH2 CH1 1 109.500 460.240
CH2 CH2 OM 1 109.500 460.240
CH2 CH2 OA 1 109.500 460.240
CH2 CH2 N 1 109.500 460.240
CH2 CH2 NT 1 109.500 460.240
CH2 CH2 NL 1 109.500 460.240
CH2 CH2 C 1 111.000 460.240
CH2 CH2 CH1 1 111.000 460.240
CH2 CH2 CH2 1 111.000 460.240
CH3 CH2 OM 1 109.500 460.240
CH3 CH2 OA 1 111.000 460.240
CH3 CH2 CH2 1 111.000 460.240
CH3 CH2 CH1 1 111.000 460.240
CB CH2 OM 1 109.500 460.240
CB CH2 CH1 1 111.000 460.240
CB CH2 CH2 1 111.000 460.240
CHE CH2 OM 1 109.500 460.240
CHE CH2 CH1 1 111.000 460.240
CHE CH2 CH2 1 111.000 460.240
S CH2 CH1 1 113.000 460.240
S CH2 CH2 1 113.000 460.240
NE CH2 CH2 1 109.500 460.240
OS CH2 CH1 1 111.000 460.240
NR6* CH2 CH1 1 111.000 460.240
NR6* CH2 CB 1 109.500 460.240
NR6* CH2 CHE 1 109.500 460.240
NR6* CH2 CS1 1 109.500 460.240
NR5* CR51 NR5 1 108.000 418.400
NR5* CR51 NR5* 1 108.000 418.400
CB CR51 NR5 1 108.000 418.400
CB CR51 NR5* 1 108.000 418.400
CHE CR51 NR5 1 108.000 418.400
CHE CR51 NR5* 1 108.000 418.400
CR61 CR61 CR61 1 120.000 418.400
CB CR61 CH2 1 126.000 418.400
CB CR61 CR61 1 120.000 418.400
CB CR61 CB 1 120.000 418.400
CHE CR61 CH2 1 126.000 418.400
CHE CR61 CR61 1 120.000 418.400
CHE CR61 CB 1 120.000 418.400
NR6 CR61 CB 1 120.000 418.400
NR6 CR61 CHE 1 120.000 418.400
NR6 CR61 NR6 1 120.000 418.400
NR6* CR61 CR61 1 120.000 418.400
NR6* CR61 CB 1 120.000 418.400
NR6* CR61 CHE 1 120.000 418.400
CS2 CR61 CR61 1 120.000 418.400
CH2 CB NR5 1 126.000 418.400
CH2 CB NR5* 1 126.000 418.400
CR51 CB NR5 1 108.000 418.400
CR51 CB NR5* 1 108.000 418.400
CR51 CB CH2 1 126.000 418.400
CR61 CB OA 1 120.000 418.400
CR61 CB NT 1 120.000 418.400
CR61 CB NR5* 1 132.000 418.400
CR61 CB NP 1 126.000 418.400
CR61 CB C 1 120.000 418.400
CR61 CB CH2 1 120.000 418.400
CR61 CB CH3 1 120.000 418.400
CR61 CB CR61 1 120.000 418.400
CB CB O 1 120.000 418.400
CB CB NT 1 120.000 418.400
CB CB NR5 1 108.000 418.400
CB CB NR5* 1 108.000 418.400
CB CB NP 1 108.000 418.400
CB CB CH2 1 126.000 418.400
CB CB CH3 1 120.000 418.400
CB CB CR51 1 108.000 418.400
CB CB CR61 1 120.000 418.400
CB CB CB 1 120.000 418.400
NR6 CB O 1 120.000 418.400
NR6 CB NT 1 120.000 418.400
NR6 CB NR5* 1 132.000 418.400
NR6 CB CH2 1 120.000 418.400
NR6 CB CR61 1 120.000 418.400
NR6 CB CB 1 120.000 418.400
NR6 CB NR6 1 120.000 418.400
NR6* CB O 1 120.000 418.400
NR6* CB NT 1 120.000 418.400
NR6* CB CR61 1 120.000 418.400
NR6* CB CB 1 120.000 418.400
NR6* CB NR6 1 120.000 418.400
NR6* CB NR6* 1 120.000 418.400
CS2 CB C 1 120.000 418.400
CS2 CB CH2 1 120.000 418.400
CS2 CB CR61 1 120.000 418.400
CS2 CB NR6 1 120.000 418.400
CH2 CHE NR5 1 126.000 418.400
CH2 CHE NR5* 1 126.000 418.400
CR51 CHE NR5 1 108.000 418.400
CR51 CHE NR5* 1 108.000 418.400
CR51 CHE CH2 1 126.000 418.400
CR61 CHE OA 1 120.000 418.400
CR61 CHE NT 1 120.000 418.400
CR61 CHE NR5* 1 132.000 418.400
CR61 CHE NP 1 126.000 418.400
CR61 CHE C 1 120.000 418.400
CR61 CHE CH2 1 120.000 418.400
CR61 CHE CH3 1 120.000 418.400
CR61 CHE CR61 1 120.000 418.400
CB CHE O 1 120.000 418.400
CB CHE NT 1 120.000 418.400
CB CHE NR5 1 108.000 418.400
CB CHE NR5* 1 108.000 418.400
CB CHE NP 1 108.000 418.400
CB CHE CH2 1 126.000 418.400
CB CHE CH3 1 120.000 418.400
CB CHE CR51 1 108.000 418.400
CB CHE CR61 1 120.000 418.400
CB CHE CB 1 120.000 418.400
CHE CHE O 1 120.000 418.400
CHE CHE NT 1 120.000 418.400
CHE CHE NR5 1 108.000 418.400
CHE CHE NR5* 1 108.000 418.400
CHE CHE NP 1 108.000 418.400
CHE CHE CH2 1 126.000 418.400
CHE CHE CR51 1 108.000 418.400
CHE CHE CB 1 120.000 418.400
NR6 CHE O 1 120.000 418.400
NR6 CHE NT 1 120.000 418.400
NR6 CHE NR5* 1 132.000 418.400
NR6 CHE CH2 1 120.000 418.400
NR6 CHE CR61 1 120.000 418.400
NR6 CHE CB 1 120.000 418.400
NR6 CHE CHE 1 120.000 418.400
NR6 CHE NR6 1 120.000 418.400
NR6* CHE O 1 120.000 418.400
NR6* CHE NT 1 120.000 418.400
NR6* CHE CR61 1 120.000 418.400
NR6* CHE CB 1 120.000 418.400
NR6* CHE NR6 1 120.000 418.400
NR6* CHE NR6* 1 120.000 418.400
CS2 CHE C 1 120.000 418.400
CS2 CHE CH2 1 120.000 418.400
CS2 CHE CR61 1 120.000 418.400
CS2 CHE NR6 1 120.000 418.400
CH3 S O 1 107.000 460.240
CH3 S CH2 1 100.000 460.240
CH3 S CH3 1 97.000 460.240
HS S CH2 1 96.000 397.480
S S CH2 1 104.000 460.240
NP FE NR5 1 115.000 41.840
NP FE NP 1 90.000 418.400
H NZ C 1 120.000 292.880
H NZ H 1 120.000 334.720
CH2 NE C 1 124.000 502.080
H NE C 1 120.000 292.880
H NE CH2 1 116.000 376.560
OM P OM 1 120.000 585.760
OA P OM 1 109.600 397.480
OS P OM 1 109.600 397.480
OS P OA 1 103.000 397.480
OS P OS 1 103.000 397.480
P OS CH2 1 120.000 397.480
P OS P 1 120.000 397.480
CS1 OS P 1 120.000 397.480
CS1 OS CS1 1 109.500 334.720
CS2 OS P 1 120.000 397.480
SI OS CS1 1 120.000 397.480
SI OS CS2 1 120.000 397.480
SI OS SI 1 155.000 397.480
OS CS1 NR5* 1 109.500 284.512
CS1 CS1 OA 1 109.500 284.512
CS1 CS1 NR5* 1 109.500 284.512
CS1 CS1 OS 1 109.500 284.512
CS1 CS1 CS1 1 109.500 251.040
NR6* CS1 CH2 1 109.500 251.040
NR6* CS1 OS 1 109.500 284.512
NR6* CS1 CS1 1 109.500 251.040
CS2 CS1 OA 1 109.500 284.512
CS2 CS1 NR5* 1 109.500 284.512
CS2 CS1 CH2 1 109.500 251.040
CS2 CS1 OS 1 109.500 284.512
CS2 CS1 CS1 1 109.500 251.040
CS2 CS1 NR6* 1 109.500 251.040
CB NR6 CR61 1 120.000 418.400
CB NR6 CB 1 120.000 418.400
CHE NR6 CR61 1 120.000 418.400
CHE NR6 CB 1 120.000 418.400
CHE NR6 CHE 1 120.000 418.400
CH3 NR6* CH2 1 120.000 418.400
CR61 NR6* CR61 1 120.000 418.400
CB NR6* CH2 1 120.000 418.400
CB NR6* CH3 1 120.000 418.400
CB NR6* CR61 1 120.000 418.400
CB NR6* CB 1 120.000 418.400
CHE NR6* CH2 1 120.000 418.400
CHE NR6* CH3 1 120.000 418.400
CHE NR6* CR61 1 120.000 418.400
CHE NR6* CB 1 120.000 418.400
CHE NR6* CHE 1 120.000 418.400
H NR6* CH2 1 120.000 376.560
H NR6* CB 1 120.000 376.560
H NR6* CHE 1 120.000 376.560
CS1 NR6* CR61 1 120.000 418.400
CS1 NR6* CB 1 120.000 418.400
CS1 NR6* CHE 1 120.000 418.400
CS1 NR6* H 1 120.000 376.560
CS2 NR6* CB 1 120.000 418.400
CS2 NR6* CHE 1 120.000 418.400
CS2 NR6* H 1 120.000 376.560
CB CS2 CR61 1 120.000 418.400
CHE CS2 CR61 1 120.000 418.400
CS1 CS2 OA 1 109.500 284.512
CS1 CS2 OS 1 109.500 284.512
CS1 CS2 CS1 1 109.500 251.040
NR6* CS2 CB 1 120.000 418.400
NR6* CS2 CHE 1 120.000 418.400
NR6* CS2 CS1 1 120.000 418.400
CH1 SI CH1 1 109.500 397.480
OS SI CH1 1 109.500 397.480
OS SI OS 1 109.500 397.480
F C F 1 107.600 460.240
CH2 C F 1 111.400 460.240
C CH2 OA 1 110.900 460.240
CS1 OS CH2 1 112.900 397.480
OS CH2 CH2 1 107.900 460.240
CR6 CR6 HCR 1 120.000 376.560
CR5 CR6 HCR 1 120.000 376.560
CB CR6 HCR 1 120.000 376.560
CB CR5 HCR 1 120.000 376.560
CHE CR6 HCR 1 120.000 376.560
CHE CR5 HCR 1 120.000 376.560
NR5* CR5 HCR 1 120.000 376.560
NR5* CR6 HCR 1 120.000 376.560
CB CR51 CR51 1 108.000 418.400
CHE CR51 CR51 1 108.000 418.400
H N H 1 109.500 334.720
C CH1 OA 1 109.500 460.240
NL CH1 CH3 1 109.500 460.240
CH2 S S 1 104.000 460.240
NR5* CB CR61 1 132.000 418.400
CH1 CB NR5 1 126.000 418.400
; CB NR5 CR51 1 125.000 251.040
CB C NR6* 1 120.000 418.400
NR5* CHE CR61 1 132.000 418.400
CH1 CHE NR5 1 126.000 418.400
; CHE NR5 CR51 1 125.000 251.040
CHE C NR6* 1 120.000 418.400
O C NR6* 1 120.000 418.400
C NR6* H 1 120.000 376.560
CB CB C 1 120.000 418.400
NR6 CB C 1 120.000 418.400
CHE CB C 1 120.000 418.400
CB CHE C 1 120.000 418.400
CHE CHE C 1 120.000 418.400
NR6 CHE C 1 120.000 418.400
C NR6* C 1 120.000 418.400
NR6 CB NR6* 1 120.000 418.400
NR6 CB O 1 120.000 418.400
NR6 CHE NR6* 1 120.000 418.400
NR6 CHE O 1 120.000 418.400
CH2 NT CH1 1 116.000 502.080
CR5 CB CH2 1 126.000 418.400
CR5 CHE CH2 1 126.000 418.400
CB CB CR5 1 108.000 418.400
CHE CB CR5 1 108.000 418.400
CB CHE CR5 1 108.000 418.400
CHE CHE CR5 1 108.000 418.400
CB CR5 NR5* 1 108.000 418.400
CHE CR5 NR5* 1 108.000 418.400
CB CB CR6 1 120.000 418.400
CB CHE CR6 1 120.000 418.400
CHE CB CR6 1 120.000 418.400
CHE CHE CR6 1 120.000 418.400
H NR5* CR5 1 126.000 376.560
CB NR5* CR5 1 108.000 418.400
CHE NR5* CR5 1 108.000 418.400
CR6 CB NR5* 1 132.000 418.400
CR6 CHE NR5* 1 132.000 418.400
CB CR6 CH2 1 126.000 418.400
CHE CR6 CH2 1 126.000 418.400
CB CR6 CR6 1 120.000 418.400
CHE CR6 CR6 1 120.000 418.400
CB CR6 CB 1 120.000 418.400
CB CR6 CHE 1 120.000 418.400
CHE CR6 CB 1 120.000 418.400
CHE CR6 CHE 1 120.000 418.400
NR6 CR6 CB 1 120.000 418.400
CR6 CR6 CR6 1 120.000 418.400
CR6 CB CH2 1 120.000 418.400
CR6 CHE CH2 1 120.000 418.400
CR6 CB CR6 1 120.000 418.400
CR6 CHE CR6 1 120.000 418.400
CB CR6 CH2 1 126.000 418.400
CHE CR6 CH2 1 126.000 418.400
CB CR6 CR6 1 120.000 418.400
CHE CR6 CR6 1 120.000 418.400
CB CR6 CB 1 120.000 418.400
CB CR6 CHE 1 120.000 418.400
CHE CR6 CB 1 120.000 418.400
CHE CR6 CHE 1 120.000 418.400
NR6 CR6 CB 1 120.000 418.400
NR6 CR6 CHE 1 120.000 418.400
NR6 CR6 NR6 1 120.000 418.400
NR6* CR6 CR6 1 120.000 418.400
NR6* CR6 CB 1 120.000 418.400
NR6* CR6 CHE 1 120.000 418.400
CS2 CR6 CR6 1 120.000 418.400
CR6 CB OA 1 120.000 418.400
CR6 CB NT 1 120.000 418.400
CR6 CB NR5* 1 132.000 418.400
CR6 CB NP 1 126.000 418.400
CR6 CB C 1 120.000 418.400
CR6 CB CH2 1 120.000 418.400
CR6 CB CH3 1 120.000 418.400
CR6 CB CR6 1 120.000 418.400
CR6 CHE OA 1 120.000 418.400
CR6 CHE NT 1 120.000 418.400
CR6 CHE NR5* 1 132.000 418.400
CR6 CHE NP 1 126.000 418.400
CR6 CHE C 1 120.000 418.400
CR6 CHE CH2 1 120.000 418.400
CR6 CHE CH3 1 120.000 418.400
CR6 CHE CR6 1 120.000 418.400
CP2 CP2 CP2 1 111.000 460.240
CP2 CP2 CP3 1 111.000 460.240
C CP2 CP2 1 111.000 460.240
O C CP2 1 121.000 502.080
OA C CP2 1 115.000 502.080
OS C CP2 1 121.000 502.080
CH1 CH2 OS 1 111.000 460.240
CH1 OS C 1 119.000 397.480
CH2 CH1 OS 1 106.000 397.480
OS C O 1 124.000 397.480
CH2 OS C 1 119.000 397.480
NE C NE 1 120.000 502.080
CR61 CHE CHE 1 126.000 418.400
CHE CHE CHE 1 108.000 418.400
CHE CHE CH3 1 126.000 418.400
CHE CR61 CHE 1 126.000 418.400
OM S OM 1 109.500 520.000
[ dihedraltypes ]
; i l func q0 cq
NR5* NR5 2 0.000 167.360
NR5* NR5* 2 0.000 167.360
C O 2 0.000 167.360
C OM 2 0.000 167.360
C NT 2 0.000 167.360
CH1 OA 2 35.264 334.720
CH1 CH1 2 35.264 334.720
CH2 N 2 0.000 167.360
CH2 NT 2 0.000 167.360
CH2 C 2 0.000 167.360
CH2 CH1 2 35.264 334.720
CH3 CH1 2 35.264 334.720
CR51 NR5 2 0.000 167.360
CR51 NR5* 2 0.000 167.360
CR51 CR51 2 0.000 167.360
CR61 CR61 2 0.000 167.360
CB O 2 0.000 167.360
CB OA 2 0.000 167.360
CB NT 2 0.000 167.360
CB NR5 2 0.000 167.360
CB NR5* 2 0.000 167.360
CB NP 2 0.000 167.360
CB C 2 0.000 167.360
CB CH2 2 0.000 167.360
CB CH3 2 0.000 167.360
CB CR51 2 0.000 167.360
CB CR61 2 0.000 167.360
CB CB 2 0.000 167.360
CHE O 2 0.000 167.360
CHE OA 2 0.000 167.360
CHE NT 2 0.000 167.360
CHE NR5 2 0.000 167.360
CHE NR5* 2 0.000 167.360
CHE NP 2 0.000 167.360
CHE C 2 0.000 167.360
CHE CH2 2 0.000 167.360
CHE CH3 2 0.000 167.360
CHE CR51 2 0.000 167.360
CHE CR61 2 0.000 167.360
CHE CB 2 0.000 167.360
CHE CHE 2 0.000 167.360
H N 2 0.000 167.360
H NT 2 0.000 167.360
H NL 2 35.264 334.720
H NR5* 2 0.000 167.360
FE NP 2 0.000 167.360
NZ C 2 0.000 167.360
NE C 2 0.000 167.360
NE H 2 0.000 167.360
CS1 NR5* 2 0.000 167.360
CS1 CH2 2 35.264 334.720
CS1 CB 2 0.000 167.360
CS1 CHE 2 0.000 167.360
CS1 CS1 2 35.264 334.720
NR6 CR61 2 0.000 167.360
NR6 CB 2 0.000 167.360
NR6 CHE 2 0.000 167.360
NR6 NR6 2 0.000 167.360
NR6* CH2 2 0.000 167.360
NR6* CH3 2 0.000 167.360
NR6* CR61 2 0.000 167.360
NR6* CB 2 0.000 167.360
NR6* CHE 2 0.000 167.360
NR6* H 2 0.000 167.360
NR6* CS1 2 0.000 167.360
NR6* NR6 2 0.000 167.360
NR6* NR6* 2 0.000 167.360
CS2 CB 2 0.000 167.360
CS2 CHE 2 0.000 167.360
CS2 CS1 2 35.264 334.720
CS2 NR6* 2 0.000 167.360
SI CH1 2 35.264 334.720
C CH1 2 0.000 167.360
NR6 C 2 0.000 167.360
C C 2 0.000 167.360
C NR6* 2 0.000 167.360
NR6 CH2 2 0.000 167.360
CR5 HCR 2 0.000 167.360
CR6 HCR 2 0.000 167.360
CR5 CR5 2 0.000 167.360
CB CR5 2 0.000 167.360
CHE CR5 2 0.000 167.360
NR6 CR5 2 0.000 167.360
NR6* CR5 2 0.000 167.360
CR5 NR5 2 0.000 167.360
CR5 NR5* 2 0.000 167.360
CR5 CR5 2 0.000 167.360
CB CR5 2 0.000 167.360
CB CR6 2 0.000 167.360
CHE CR5 2 0.000 167.360
CHE CR6 2 0.000 167.360
CR6 CR6 2 0.000 167.360
OS C 2 0.000 167.360
C O 2 0.000 167.360
CH1 OS 2 35.264 334.720
CH1 OA 2 35.264 334.720
[ dihedraltypes ]
; j k func phi0 cp mult
C OA 1 180.000 16.736 2
C N 1 180.000 33.472 2
C NT 1 180.000 33.472 2
C NL 1 0.000 3.766 3
CH1 OA 1 0.000 1.255 3
CH1 N 1 180.000 0.418 6
CH1 NT 1 0.000 3.766 6
CH1 NL 1 0.000 3.766 3
CH1 C 1 0.000 0.418 6
CH1 CH1 1 0.000 5.858 3
CH2 OA 1 0.000 1.255 3
CH2 N 1 180.000 0.418 6
CH2 NT 1 0.000 3.766 6
CH2 NL 1 0.000 3.766 3
CH2 C 1 0.000 0.418 6
CH2 CH1 1 0.000 5.858 3
CH2 CH2 1 0.000 5.858 3
CB OA 1 180.000 7.113 2
CB NT 1 180.000 33.472 2
CB C 1 180.000 5.858 2
CB CH2 1 0.000 0.418 6
CB CR61 1 180.000 41.840 2
CHE OA 1 180.000 7.113 2
CHE NT 1 180.000 33.472 2
CHE C 1 180.000 5.858 2
CHE CH2 1 0.000 0.418 6
CHE CR61 1 180.000 41.840 2
S CH2 1 0.000 2.929 3
S S 1 0.000 16.736 2
FE NR5 1 0.000 0.000 4
NZ C 1 180.000 33.472 2
NE C 1 180.000 33.472 2
NE CH2 1 180.000 0.418 6
; two or three dihedral potentials are needed over some bonds,
; put the parameters in your topology manually
; P OA 1 0.000 1.046 3
; P OA 1 0.000 3.138 2
OS CH2 1 0.000 3.766 3
; OS P 1 0.000 1.046 3
; OS P 1 0.000 3.138 2
CS1 OA 1 0.000 1.255 3
CS1 NR5* 1 0.000 0.000 2
CS1 CH2 1 0.000 5.858 3
CS1 OS 1 0.000 3.766 3
; CS1 CS1 1 0.000 5.858 3
; CS1 CS1 1 0.000 0.418 2
; CS1 CS1 1 0.000 2.092 2
NR6 CB 1 180.000 33.472 2
NR6 CHE 1 180.000 33.472 2
NR6* CH2 1 0.000 0.418 6
NR6* CB 1 180.000 33.472 2
NR6* CHE 1 180.000 33.472 2
NR6* CS1 1 0.000 0.000 2
CS2 OA 1 0.000 1.255 3
CS2 OS 1 0.000 3.766 3
; CS2 CS1 1 0.000 5.858 3
; CS2 CS1 1 0.000 0.418 2
; CS2 CS1 1 0.000 2.092 2
SI CH1 1 0.000 5.858 3
SI OS 1 0.000 3.766 3
C CP2 1 0.000 0.418 6
CH1 OS 1 0.000 3.766 3
C OS 1 0.000 3.766 3
CP2 CP2 1 0.000 0.418 6
[ dihedraltypes ]
CP2 CP2 3 9.2789 12.156 -13.120 -3.0597 26.240 -31.495
CH2 CH2 3 9.2789 12.156 -13.120 -3.0597 26.240 -31.495
#define ANG_180_0 180 0
#define DIH_0_0_2 0 0 2
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