gromacs-data 4.5.5-2 / usr / share / gromacs / top / gmx.ff / dlg.itp

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; topology for 1,2-dilauroyl-sn-glycerol. Peter Tieleman, April 2 1995

[ moleculetype ]
;name    nrexcl
DLG         3

[ atoms ]
;   nr    type   resnr  residu    atom    cgnr        charge    ; total charge
     1     CH2       1    DLG     C1        1     0.1500       ; 0.15
     2      OA       1    DLG     OA2       1    -0.5480       ; -0.4
     3      HO       1    DLG     HO3       1     0.3980       ; 0
     4     CH1       1    DLG     C4        2     0.1000       ; 0.10
     5      OS       1    DLG     OS5       2    -0.1800       ; -0.08
     6       C       1    DLG     C6        2     0.2700       ; 0.19
     7       O       1    DLG     O7        2    -0.1900       ; 0      
     8     CP2       1    DLG     C8        3     0		
     9     CP2       1    DLG     C9        4     0
    10     CP2       1    DLG     C10       5     0
    11     CP2       1    DLG     C11       6     0
    12     CP2       1    DLG     C12       7     0
    13     CP2       1    DLG     C13       8     0
    14     CP2       1    DLG     C14       9     0
    15     CP2       1    DLG     C15      10     0
    16     CP2       1    DLG     C16      11     0
    17     CP2       1    DLG     C17      12     0
    18     CP3       1    DLG     C18      13     0
    19     CH2       1    DLG     C19      14     0.1000
    20      OS       1    DLG     OS2      14    -0.1800
    21       C       1    DLG     C21      14     0.2700
    22       O       1    DLG     O22      14    -0.1900
    23     CP2       1    DLG     C23      15     0
    24     CP2       1    DLG     C24      16     0
    25     CP2       1    DLG     C25      17     0
    26     CP2       1    DLG     C26      18     0
    27     CP2       1    DLG     C27      19     0
    28     CP2       1    DLG     C28      20     0
    29     CP2       1    DLG     C29      21     0
    30     CP2       1    DLG     C30      22     0
    31     CP2       1    DLG     C31      23     0
    32     CP2       1    DLG     C32      24     0
    33     CP3       1    DLG     C33      25     0

[ bonds ]
;  ai    aj funct           c0           c1
    3     2     1 
    1     2     1 
    1     4     1 
    4     5     1 
    6     5     1 
    6     7     1 
    8     6     1 
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   31    32     1 
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[ pairs ]
;  ai    aj funct   
    1     6     1  ;
    1    20     1  ;
    2     5     1  ;
    2    19     1  ;
    3     4     1  ;
    4     7     1  ;
    4     8     1  ;
    4    21     1  ;
    5     9     1  ;
    5    20     1  ;
    6    10     1  ;
    6    19     1  ;
    7     9     1  ;
;    8    11     1 ; Not used for Ryckaert-Bellemans potential
;    9    12     1 ; 
;   10    13     1 ; 
;   11    14     1 ; 
;   12    15     1 ; 
;   13    16     1 ; 
;   14    17     1 ; 
;   15    18     1 ; 
   19    22     1  ;
   19    23     1  ;
   20    24     1  ;
   21    25     1  ;
   22    24     1  ;
;   23    26     1 ; 
;   24    27     1 ; 
;   25    28     1 ; 
;   26    29     1 ; 
;   27    30     1 ; 
;   28    31     1 ; 
;   29    32     1 ; 
;   30    33     1  

[ angles ]
;  ai    aj    ak funct           c0           c1
    3     2     1     1
    4     1     2     1
    1     4     5     1
    4     5     6     1
    5     6     7     1
    8     6     7     1
    9     8     6     1
    8     9    10     1
    9    10    11     1
   10    11    12     1
   11    12    13     1
   12    13    14     1
   13    14    15     1
   14    15    16     1
   15    16    17     1
   16    17    18     1
    1     4    19     1
   19     4     5     1
    4    19    20     1
   19    20    21     1
   20    21    22     1
   23    21    22     1
   21    23    24     1
   23    24    25     1
   24    25    26     1
   25    26    27     1
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   28    29    30     1
   29    30    31     1
   30    31    32     1
   31    32    33     1

[ dihedrals ]
;  ai    aj    ak    al funct           c0           c1           c2
    4     1     2     3     1
    2     1     4     5     1
    2     1     4    19     1
   20    19     4     1     1
   20    19     4     5     1
    1     4     5     6     1
   19     4     5     6     1
    7     6     5     4     1
    8     6     5     4     1
    9     8     6     5     1
    9     8     6     7     1
    6     8     9    10     1
    8     9    10    11     3
    9    10    11    12     3
   10    11    12    13     3
   11    12    13    14     3
   12    13    14    15     3
   13    14    15    16     3
   14    15    16    17     3
   15    16    17    18     3
   21    20    19     4     1
   22    21    20    19     1
   23    21    20    19     1
   24    23    21    20     1
   24    23    21    22     1
   21    23    24    25     1
   23    24    25    26     3
   24    25    26    27     3
   25    26    27    28     3
   26    27    28    29     3
   27    28    29    30     3
   28    29    30    31     3
   29    30    31    32     3
   30    31    32    33     3

[ dihedrals ]
;  ai    aj    ak    al funct
    4     1    19     5     2
    6     5     8     7     2
   21    20    23    22     2

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